現代農業(yè)發(fā)展離不開化肥，化肥在給農作物帶來營養(yǎng)的同時也會因為施用不當對周邊土壤和環(huán)境造成整體影響。一是化肥施用不當造成的土壤板結、鹽漬化。二是殘留在土壤中的化肥被暴雨沖刷后匯入水體，加劇了水體的"富營養(yǎng)化"，導致水草繁生，許多水塘、水庫、湖泊因此變臭，成為"死水"。

當前化肥施用存在兩個誤區(qū)：一是認為"化肥就是氮肥"，氮肥的施用量遠大于其他肥料，只搞單一施肥，忽視了平衡施肥。二是我國目前存在明顯的化肥過度施用的情況。

　　根據數據顯示，我國農作物畝均化肥用量21.9公斤，遠高于世界的平均水平（每畝8公斤），是美國的2.6倍，歐盟的2.5倍。中國的耕地肥力出現了明顯下降，全國土壤有機質平均不到1%。與之對應的是，國內的化肥用量及其增長速度驚人。不僅僅是過度施肥和用肥單一，還經常出現忽略了地情變化，照"老經驗"施肥的誤區(qū)，加劇了土壤內在結構的不平衡。

　　針對現存問題，微生物菌肥可以成為綠色農業(yè)的突破口。微生物菌肥中的有效活菌數高，可以顯著增加土壤中的有益菌群，這些有益菌通過降解各種污染，分解多種動物腐體和植物殘茬等活動使得板結土壤通透性增加；生物菌肥并且有益微生物在生長繁殖時能分泌有益物質，能活化板結土壤中被固定的養(yǎng)分，從而起到疏松土壤、培肥地力的作用。

　　我國新型菌肥的產量所占的比重越來越大。而微生物菌肥已成為新型肥料中年產量最大、應用面積最廣的品種，微生物菌肥會成為綠色農業(yè)發(fā)展的強大助力。微生物菌肥還有以下幾種優(yōu)勢。

　　1、微生物菌肥具有提高化肥利用率的作用

　　近年來我國化肥的使用量上漲4.5倍，但我國糧食產量僅增長了82.8%，三大糧食作物氮肥、磷肥、鉀肥的利用率卻僅為33%、24%和42%。這說明僅靠大量增施化肥來提高作物產量是有限的，況且還會造成土壤和環(huán)境污染的問題。采用微生物菌肥與化肥配合施用，既能保證增產，又減少了化肥使用量，降低成本，同時還能改善土壤及作物品質，減少污染。

　　2、微生物菌肥在綠色食品生產中的作用

　　隨著人民生活水平的不斷提高，尤其是人們對生活質量提高的要求，對綠色無公害的食品需求不斷提升。生產綠色食品的過程中要求不用或盡量少用或限量使用化肥或農藥等化學物質的施用。微生物菌肥能保護和促進農作物生長和提高品質；其次不會產生和積累有害物質；三是對生態(tài)環(huán)境和土壤環(huán)境無不良影響。符合了綠色食品生產和綠色農業(yè)發(fā)展的要求。

　　3、微生物菌肥在環(huán)保中的作用

　　利用微生物的特定功能分解發(fā)酵城市生活垃圾及農牧業(yè)廢棄物，制成微生物菌肥，能將城市生活垃圾合理再利用。另外還有將微生物菌肥作為土壤凈化劑使用。